在成功击退敌对势力的袭击后，联盟暂时迎来了一段相对平静的时光。然而，汤姆和他的队员们深知，这只是暴风雨前的宁静，他们必须利用这段时间，为可能到来的更大挑战做好充分准备。

汤姆坐在办公室里，阳光透过窗户洒在他疲惫的脸上。他面前的桌子上堆满了文件和报告，都是关于晶体研究的最新进展以及联盟内部的各种事务。他揉了揉太阳穴，试图缓解连续工作带来的压力。

这时，艾米丽轻轻地敲门走了进来。她的脸上带着一丝忧虑，说道：“汤姆，科学家们对晶体的研究有了新的发现，但情况比我们想象的还要复杂。”

汤姆抬起头，目光中透露出坚定：“详细说说。”

艾米丽走到桌前，将手中的资料递给汤姆：“他们发现晶体内部的能量结构似乎存在着自我进化的能力，这意味着我们之前的一些研究成果可能需要重新评估。”

汤姆皱起眉头，仔细翻阅着手中的资料：“这确实是个棘手的问题。如果晶体的能量结构不断变化，我们很难找到一种稳定且有效的利用方法。”

艾米丽接着说：“而且，由于这种不确定性，一些研究人员开始对我们的研究方向产生了质疑，团队内部的士气也受到了一定的影响。”

汤姆站起身来，走到窗前，望着窗外的星空：“我们不能被这些困难打倒。必须尽快组织一次内部会议，重新梳理我们的研究思路，统一大家的目标。”

几天后，联盟总部的一间会议室里坐满了参与晶体研究的科学家和工程师。汤姆站在讲台上，神情严肃地说道：“各位，我们都清楚目前面临的困境。但请记住，我们的目标是为了联盟的未来，为了宇宙的和平。晶体的力量如果能够被正确运用，将是我们保护家园的强大武器。”

一位资深的科学家举手发言：“汤姆，但是我们如何应对晶体能量结构的自我进化呢？这似乎是一个无法预测的变量。”

汤姆思考片刻后回答道：“我们不能被未知吓倒。我建议成立多个专项小组，分别从不同的角度去研究这个问题。同时，加强与其他科研机构的合作，集思广益。”

会议在热烈的讨论中持续了几个小时，最终确定了一系列新的研究方案和分工。

在研究工作紧张进行的同时，联盟的外交事务也变得日益繁忙。周边的一些星系对联盟拥有晶体表现出了强烈的关注和担忧。他们担心联盟会凭借晶体的力量扩张势力范围，打破宇宙现有的平衡。

汤姆决定亲自参与外交工作，试图消除这些星系的疑虑。他带领着队员们首先访问了一个名为“光明星系”的地方。

在光明星系的首府星球上，汤姆与星系的领导人进行了一场艰难的谈判。

“汤姆先生，我们对联盟的晶体研究感到非常不安。这可能会引发一场宇宙范围内的军备竞赛。”光明星系的领导人说道。

汤姆诚恳地回答：“尊敬的领导人，我们的初衷绝非如此。晶体的研究是为了防御潜在的威胁，而不是为了侵略和扩张。我们希望能够与贵星系建立友好的合作关系，共同维护宇宙的和平与稳定。”