朱聿键（1602年—1646年）是一位胸怀大志的君主，精史事，好读书，俭朴爱民。他在位期间，励精图治，组织军队抗击清军并多次出兵北伐。

只可惜他虽有雄心，却无实权，以郑芝龙、郑芝豹等人为首的郑氏家族本是海盗头子出身，各个骄横傲慢，隆武帝被架空。幸好郑氏家族还有一个忠臣郑成功（1624年—1662年），他是郑芝龙的儿子。

隆武帝不仅无实权，还有掣肘。

弘光帝被杀以后，鲁王朱以海在浙江绍兴被推举为监国，沿用弘光年号。两个朱姓政权为争正统开始互相攻讦。

隆武帝于内受制于郑氏家族，于外则有清军步步紧逼，同时还要提防鲁王背刺，实在无以为继。公元1646年，清军进攻福建，郑芝龙降清，朱聿键被俘后绝食而死。

他的弟弟唐王朱聿鐭逃到广州继位，是为绍武帝，他只当了一个月皇帝，就在清军追击下自缢身亡。

而明神宗朱翊钧的另一个孙子朱由榔则在广东肇庆称帝，是为永历帝。他当了十六年皇帝，后逃亡缅甸。

吴三桂以平西大将军职南征云贵，迫使缅甸王交出永历帝后用弓弦活活勒死。

南明灭亡，剩下的朱明一脉流落到了台湾。

天启年间，荷兰人攻袭澳门，被葡萄牙人击退后转战澎湖和鼓浪屿，被明军武力驱逐后霸占了宝岛台湾。

隆武政权灭亡后，郑成功在东南沿海招兵买马，誓师反清，后来鲁王朱以海来到厦门投靠郑成功。

公元1661年，郑成功率军赶走荷兰人，收复台湾。他奉南明永历帝为正主，以永历为年号。

他登岛只一年便去世，军权由其子郑经继承。实际上，所谓的南明政权这时已不姓朱，而改姓郑了。

公元1683年，康熙帝在位期间，清军逼使明郑降清，明朝宁靖王朱术桂自杀殉国。

明朝彻底成为历史，中国正式进入清朝。