因为它位于慕士塔格冰峰下的苏巴什草原上，在白雪的映衬下，深邃的高山湖水其色似墨，因而得此名字。

也有人说，喀拉库勒湖是伟大的湖，因为“喀拉”在柯尔克孜族的民族语言中又有伟大的意思。

喀拉库勒湖还被人称为姊妹湖，因为它是两湖相连，就像一对手拉手的孪生姊妹。

有关这个湖，也有一个美丽的传说：

相传在很早以前，帕米尔高原上并没有幕士塔格、公格尔、公格尔九别峰和姊妹湖，而是一望无际的平坦大牧场。

牧场上住着一对柯尔克孜族夫妇，贤淑的妻子为牧人生下一对美丽的小女儿之后，就离开了人世。

牧人含辛茹苦，精心照料着心爱的女儿。这一对小姐妹聪明伶俐，但却瘦弱多病，牧人为此常常坐卧不宁。

一天夜里，牧人突然做了一个梦。

梦里一个神人告诉他，东方日出处，有一座日月仙山，山上有一块日月宝镜。

如果能够取到那块宝镜，让女儿照一照就会百病俱除，身体健康。

为了能治好两个女儿的病，第二天，牧人就告别了女儿，向日出方向走去。

牧人走后，两个女儿每天都牧放着羊群，望着东方的小路，盼望着父亲归来。

不知过了多久，两个女儿头发变白了，眼泪哭干了，变成了两座大山。

这就是姊妹峰——那山顶的皑皑白雪、是她们的白发；那山腰的条条冰川，是她们的道道泪水；那一座座小雪峰，是她们牧放的绵羊。

而那牧人历尽艰险，终于取回了日月宝镜。

当他回到家中，看到心爱的一双儿女变成了雪山时，捧在手里的宝镜一下掉在地上，摔成了两半，变成了两泓湖水，这就是姊妹湖。

牧人静静地站在女儿面前，也变成了一座雪山，这就是被称"冰山之父"的慕土塔格峰。

牧人的愿望实现了，两个姊妹永生了，而且将玉容永远映在父亲取回的宝镜之中。

站在姊妹湖畔，会发现姊妹峰的倒影，始终并肩在姊妹湖之中……

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